Γενική Διεύθυνση Φορολογίας (Γ.Δ.Φ.)

Διεύθυνση Ελεγκτικών Διαδικασιών (ΔΙ.ΕΛ.ΔΙ)
Διεύθυνση Διαδικασιών Εισπράξεων & Επιστροφών (ΔΙ.Δ.ΕΙΣ.ΕΠ.)
Διεύθυνση Εφαρμογής Αμεσης Φορολογίας
Διεύθυνση Εφαρμογής Εμμεσης Φορολογίας
Διεύθυνση Εφαρμογής Φορολογίας Κεφαλαίου & Περιουσιολογίου
Διεύθυνση Διεθνών Φορολογικών Σχέσεων (Δ.Δ.ΦΟ.Σ.)
Αυτοτελές Τμήμα Υποστήριξης (Α.Τ.Υ.)
Αυτοτελές Γραφείο Διαχείρισης Κινδύνων