Γενική Διεύθυνση Τελωνείων & Ειδικών Φόρων Κατανάλωσης (Γ.Δ.Τ & Ε.Φ.Κ.)

Αυτοτελές Τμήμα Υποστήριξης
Αυτοτελές Τμήμα Διεθνών Τελεωνειακών Σχέσεων (Α.Τ.ΔΙ.Τ.Σ.)
Διεύθυνση Δασμολογικών Θεμάτων, Ειδικών Καθεστώτων & Απαλλαγών
Διεύθυνση Τελωνειακών Διαδικασιών (Δ.Τ.Δ.)
Διεύθυνση Στρατηγικής Τελωνειακών Ελέγχων και Παραβάσεων (Δ.Σ.Τ.Ε.Π)
Διεύθυνση Ειδικών Φόρων Κατανάλωσης (Ε.Φ.Κ.) και Φόρου Προστιθέμενης Αξίας (Φ.Π.Α.)
Τελωνειακή Περιφέρεια Αττικής
Τελωνειακή Περιφέρεια Θεσσαλονίκης
Τελωνειακή Περιφέρεια Αχαϊας
Επιτελική Υπηρεσία Τελωνειακών Ελέγχων (Ε.Υ.Τ.Ε.)
Ελεγκτική Υπηρεσία Τελωνείων (ΕΛ.Υ.Τ.) Αττικής
Ελεγκτική Υπηρεσία Τελωνείων (ΕΛ.Υ.Τ.) Θεσσαλονίκης
Αυτοτελές Γραφείο Διαχείρισης Κινδύνων
Τελωνειακά Ελεγκτικά Κέντρα (Τ.Ε.Κ.)