Γενική Διεύθυνση Τελωνείων & Ειδικών Φόρων Κατανάλωσης (ΓΔΤ & ΕΦΚ)

Αυτοτελές Τμήμα Υποστήριξης (ΑΤΥ)
Αυτοτελές Τμήμα Διεθνών Τελεωνειακών Σχέσεων (ΑΤΔΙΤΣ)
Διεύθυνση Δασμολογικών Θεμάτων, Ειδικών Καθεστώτων & Απαλλαγών (ΔΔΘΕΚΑ)
Διεύθυνση Τελωνειακών Διαδικασιών (ΔΤΔ)
Διεύθυνση Στρατηγικής Τελωνειακών Ελέγχων και Παραβάσεων (ΔΣΤΕΠ)
Διεύθυνση Ειδικών Φόρων Κατανάλωσης (ΕΦΚ) και Φόρου Προστιθέμενης Αξίας (ΦΠΑ)
Τελωνειακή Περιφέρεια Αττικής
Τελωνειακή Περιφέρεια Θεσσαλονίκης
Τελωνειακή Περιφέρεια Αχαϊας
Τελωνειακά Ελεγκτικά Κέντρα (ΤΕΚ)