- Περιφερειακή Διεύθυνση Ελέγχων και Ενισχύσεων Αττικής - Αιγαίου (έδρα: Αθήνα)
- Περιφερειακή Διεύθυνση Ελέγχων και Ενισχύσεων Ηπείρου - Δυτικής Μακεδονίας (έδρα: Ιωάννινα)
- Περιφερειακή Διεύθυνση Ελέγχων και Ενισχύσεων Θεσσαλίας - Στερεάς Ελλάδας (έδρα: Λάρισσα)
- Περιφερειακή Διεύθυνση Ελέγχων και Ενισχύσεων Κρήτης (έδρα: Ηράκλειο)
- Περιφερειακή Διεύθυνση Ελέγχων και Ενισχύσεων Μακεδονίας - Θράκης (έδρα: Θεσσαλονίκη)
- Περιφερειακή Διεύθυνση Ελέγχων και Ενισχύσεων Πελοποννήσου - Δυτικής Ελλάδας - Ιονίου (έδρα: Πάτρα)