- Προϊστάμενος/-η Γενικής Διεύθυνσης Γενικού Χημείου του Κράτους (Γ.Δ.Γ.Χ.Κ.)
- Αυτοτελές Τμήμα Χημικοτεχνικής Δασμολογίου
- Αυτοτελές Τμήμα Υποστήριξης (Α.Τ.Υ.)
- Δ/νση Αλκοόλης και Τροφίμων (Δ.Α.Τ.)
- Δ/νση Ενεργειακών, Βιομηχανικών και Χημικών Προϊόντων (Δ.Ε.Β.Χ.Π.)
- Δ/νση Σχεδιασμού και Υποστήριξης Εργαστηρίων (Δ.Σ.ΥΠ.Ε.)
- Προϊστάμενος/-η Γενικής Διεύθυνσης Ηλεκτρονικής Διακυβέρνησης (Γ.Δ.ΗΛΕ.Δ.)
- Αυτοτελές Τμήμα Ασφάλειας (Α.Τ.Α.)
- Αυτοτελές Τμήμα Υποστήριξης (Α.Τ.ΥΠΟ.)
- Δ/νση Ανάπτυξης Τελωνειακών, Ελεγκτικών και Επιχειρησιακών Εφαρμογών (Δ.Α.Τ.Ε.)
- Δ/νση Ανάπτυξης Φορολογικών Εφαρμογών (Δ.Α.Φ.Ε.)
- Δ/νση Διαχείρισης Υποδομών (ΔΙ.Δ.ΥΠΟΔ.)
- Δ/νση Επιχειρησιακών Διαδικασιών (ΔΙ.ΕΠΙ.ΔΙ.)
- Δ/νση Στρατηγικής Τεχνολογιών Πληροφορικής (ΔΙ.Σ.ΤΕ.ΠΛ.)
- Δ/νση Υπηρεσιών Δεδομένων (Δ.ΥΠΗ.ΔΕΔ.)
- Προϊστάμενος/-η Γενικής Διεύθυνσης Οικονομικών και Τεχνικών Υπηρεσιών (Γ.Δ.Ο.Τ.Υ.)
- Διεύθυνση Προϋπολογισμού και Δημοσιονομικών Αναφορών (Δ.Π.Δ.Α.)
- Δ/νση Οικονομικής Διαχείρισης (Δ.Ο.Δ.)
- Δ/νση Διαχείρισης και Εκμετάλλευσης Περιουσίας (ΔΙ.Δ.Ε.Π.)
- Δ/νση Στρατηγικής και Εκτέλεσης Προμηθειών (ΔΙ.Σ.Ε.Π.)
- Αυτοτελές Τμήμα Υποστήριξης & Ελέγχου (Α.Τ.Υ.Ε.)
- Αυτοτελές Γραφείο Διαχείρισης Δαπανών Ν.Σ.Κ. και Λοιπών Δαπανών
- Διεύθυνση Λογιστικής (ΔΙΕ.Λ.)
- Αυτοτελές Γραφείο Νομικής Υποστήριξης Συλλογικών Οργάνων Διενέργειας Διαδικασιών Ανάθεσης και Εκτέλεσης Δημοσίων Συμβάσεων
- Προϊστάμενος/-η Γενικής Διεύθυνσης Τελωνείων και Ειδικών Φόρων Κατανάλωσης (Γ.Δ.Τ. & Ε.Φ.Κ.)
- Αυτοτελές Τμήμα Διεθνών Τελωνειακών Σχέσεων (Α.Τ.ΔΙ.Τ.Σ.)
- Αυτοτελές Τμήμα Υποστήριξης (Α.Τ.Υ.)
- Δ/νση Δασμολογικών Θεμάτων, Ειδικών Καθεστώτων & Απαλλαγών (Δ.Δ.Θ.Ε.Κ.Α.)
- Δ/νση Ειδικών Φόρων Κατανάλωσης (Ε.Φ.Κ.) και Φόρου Προστιθέμενης Αξίας (Φ.Π.Α.)
- Διεύθυνση Στρατηγικής Τελωνειακών Ελέγχων & Παραβάσεων (Δ.Σ.Τ.Ε.Π.)
- Δ/νση Τελωνειακών Διαδικασιών (Δ.Τ.Δ.)
- Ελεγκτικές Υπηρεσίες Τελωνείων ( ΕΛ.Υ.Τ.)
- Επιτελική Υπηρεσία Τελωνειακών Ελέγχων ( Ε.Υ.Τ.Ε.)
- Τελωνειακές Περιφέρειες
- Τελωνειακά Ελεγκτικά Κέντρα (Τ.Ε.Κ.)
- Προϊστάμενος/-η Γενικής Διεύθυνσης Φορολογίας (Γ.Δ.Φ.)
- Αυτοτελές Tμήμα Υποστήριξης (Α.Τ.Υ.)
- Δ/νση Ελεγκτικών Διαδικασιών (ΔΙ.ΕΛ.ΔΙ.)
- Δ/νση Διαδικασιών Εισπράξεων και Επιστροφών (ΔΙ.Δ.ΕΙΣ.ΕΠ.)
- Δ/νση Εφαρμογής Άμεσης Φορολογίας (Δ.Ε.Α.Φ.)
- Δ/νση Εφαρμογής Έμμεσης Φορολογίας (Δ.Ε.Ε.Φ.)
- Δ/νση Εφαρμογής Φορολογίας Κεφαλαίου & Περιουσιολογίου (Δ.Ε.Φ.Κ. & Π.)
- Δ/νση Διεθνών Φορολογικών Σχέσεων (Δ.Δ.ΦΟ.Σ.)
- Προϊστάμενος/-η Γενικής Διεύθυνσης Φορολογικών Λειτουργιών (Γ.Δ.Φ.Λ.)
- Αυτοτελές Τμήμα Υποστήριξης (Α.Τ.Υ.)
- Δ/νση Επιχειρησιακού Σχεδιασμού Εισπράξεων και Επιστροφών (ΔΙ.Ε.Σ.Ε.Ε.)
- Δ/νση Επιχειρησιακού Σχεδιασμού Ελέγχων (ΔΙ.Ε.Σ.ΕΛ.)
- Δ/νση Φορολογικής Συμμόρφωσης (Δ.Φ.Σ.)
- Δ/νση Προγραμματισμού και Αξιολόγησης Ελέγχων και Ερευνών (ΔΙ.Π.Α.Ε.Ε.)
- Επιχειρησιακή Μονάδα Είσπραξης (Ε.Μ.ΕΙΣ.)
- Κέντρο Ελέγχου Μεγάλων Φορολογούμενων (Κ.Ε.ΜΕ.Φ.)
- Φορολογικές Περιφέρειες (Φ.Π.)
- Προϊστάμενος/-η Γενικής Διεύθυνσης Στρατηγικού Σχεδιασμού (Γ.Δ.Σ.Σ.)
- Δ/νση Στρατηγικού Σχεδιασμού (Δ.Σ.Σ.)
- Δ/νση Διαχείρισης Μεταρρυθμίσεων & Εργων (ΔΙ.ΔΙ.Μ.Ε.)
- Δ/νση Οικονομικών Μελετών και Προσδιορισμού Φορολογικού Κενού (Δ.Ο.Μ.Π.Φ.Κ.)
- Αυτοτελές Τμήμα Υποστήριξης & Ελέγχου (Α.Τ.Υ.Ε.)
- Αυτοτελές Γραφείο Υποστήριξης Επενδύσεων και Επιχειρηματικότητας